SEQUENCE PARALOG DAN ORTOLOG

SEQUENCE PARALOG DAN ORTOLOG

Beberapa sequence dikatakan homolog bila berasal dari leluhur yang sama. Bila beberapa organisme sama-sama membawa salinan gen tertentu yang berasal dari leluhur yang sama, maka selanjutnya dapat dilakukan perbandingan sequence tersebut untuk melihat pohon evolusinya. Akan tetapi duplikasi gen menyebabkan terjadinya salinan gen yang melimpah dalam satu organisme. Gen ortolog adalah gen yang ditemukan pada beberapa spesies berbeda dan akan membentuk variasi baru bila organisme yang membawa gen ini juga membentuk variasi baru. Gen paralog adalah salinan berlipat akibat duplikasi gen yang terdapat dalam satu organisme.

Berbagai gen yang ortolog perlu dibandingkan untuk menyusun pohon evolusi. Sebagai contoh, sequence α globin dari hewan dan α globin ortolog dari organisme lain perlu dibandingkan. Oleh karena sekelompok gen paralog memiliki sequence yang serupa, hal ini dapat menimbulkan kerancuan kecuali bila organisme leluhur tersebut telah diketahui. Namun tetap saja penelitian ini berguna untuk menentukan apakah organisme tersebut membawa sequence berlipat dari leluhur yang sama.